牡丹病毒病
癥狀:牡丹環斑病毒(PRV)在葉片上發生深綠和淺綠相同的同心輪紋圓斑，同時有小的壞死斑，植株不矮化，TRV亦變化大小紛歧的環斑或輪斑，有時則呈不規則形，而PLCV引起植株顯著矮化，下部枝條細弱扭曲，葉黃化卷曲。
病原物:
(1)牡丹環斑病毒(Peony ringspot virus,PRV)病毒粒體球狀，27納米。難以汁液摩擦接種，可以由蚜蟲傳播。
(2)煙草脆裂病毒(Tobacco rattle virus
TRV)病毒粒體有兩種，長的為190納米，短的為45-115納米。能汁液接種，報道線蟲、菟絲子和牡丹種子都能傳毒。
(3)牡丹曲葉病毒(Peony leaf curl virus,PLCV)由嫁接感染。
感染途徑:用病株分株繁殖，或作嫁接材料以及田間蚜蟲大量發生。寄主植物：PRV、PLCV為害芍藥、牡丹；TRV除芍藥、牡丹外，還為害風信子、水仙、郁金香等花卉。
牡丹白粉病
癥狀：葉片上發生白色粉霉斑，常擴大接連成片，甚至覆蓋整株葉片和莖桿，引起植株早衰或枯死。
病原物：Erysiphe aquilegiae DC.et Mer.,稱耬斗花白粉菌。
感染途徑：病菌以閉囊殼(病葉上小黑點)在病殘體上越冬，發生子囊孢子，引早先侵染。以分生孢子不停舉行再侵染。
防治方式
1、加強種植管理
施氮肥不宜過多，應適當增施鉀、鈣肥，以加強植株長勢，提高抗病力。適時修剪整形，去掉病梢、病葉，改善植株間透風、透光條件。室內盆栽時，應置于透風良好、光照足夠之處。冬季要控制室內溫濕度，夜間要注重通氣。秋末冬初移入溫室(或冷窖)前，應仔細檢查，發現病葉、病梢立刻剪除并銷毀，以免帶入室內傳播蔓延。
2、藥劑防治
發病初期噴灑15％粉銹寧愿濕性粉劑1000倍液，或70％甲基托布津可濕性粉劑1000倍液，均有良好的防治效果。粉銹寧的殘效期可達20-25天，噴藥后受病害部位的白層暗灰色，干縮并消逝。
牡丹褐斑病
牡丹褐斑病在牡丹生育后期發生。
癥狀:葉外面出現大小不同的蒼白色黑點，一般直徑為3－7毫米大小的圓斑。一葉中少時1-2個病斑，多時可達30個病斑。病斑中部逐漸變褐色，正面散生十分細小黑點，放大鏡下絨毛狀，具數層同心輪紋。相鄰病斑合并時形成不規則的大型病斑。發生嚴重時整個葉面全變為病斑而枯死。葉后頭斑病呈暗褐色，輪紋不顯著。
病原:病原菌為變色尾孢菌(Cercospora variicolor
Winter),屬絲孢綱、絲孢目。分生孢子梗淺色，偶有隔膜或愚昧，不分枝，大小為10-35×2-4微米。分生孢子無色至淡褐色，大小為40-120×2.0-3.5微米。
感染途徑:病菌以菌絲體和分生孢子在病組織和病落葉中越冬，成為第二年的侵染來源。以風雨傳播，從傷口直接侵入。多在7~9月份發病，臺風季節雨多時病重。下部葉先發病，后期管理放松，盆土過干、過濕時病重。
防治方式
1、采收后徹底清除病殘株及落葉，集中銷毀。
2、發病初期噴灑50％代森鋅可濕性粉劑500-600倍液或1：1：200波爾多液、75％百菌清可濕性粉劑500-600倍液、50％多·硫懸浮劑或36％甲．硫菌靈懸浮劑500倍液、50％混殺硫懸浮劑500倍液、77％可殺得可濕性粉劑40-500倍液，隔7-10天1次，延續防治2-3次。