根據“預防為主，綜合管理”的原則，針對不同的病蟲危害，實時有的放矢，舉行清除，確保幼苗健康生長。特別要預防日灼、立枯病和猝倒病。從出苗期到苗木木質化這段時間內，要交替使用波爾多液和FeSO4舉行預防，19%的波爾多液每周噴灑兩次，0.5%的FeSO4每周噴灑1次，如果嚴重時可延續使用波爾多液1周，每天噴灑1次。每次噴藥完畢要實時噴水沖洗，以防發生藥害。噴藥時間也很重要，以每天上午10點以前，下午4點以后較佳。

除草較幸虧漫灌后舉行。根據“除早、除小、除了”的原則，保持容器內、床面和步道無雜草。除草時一定要小心仔細，草離苗近時，將苗的周圍按住，將草緩慢拔起，確保幼苗不受危險。拔出的雜草要清算出苗圃，病株要集中銷毀，以防病害蔓延。白皮松幼苗抗寒能力較差，為使昔時生的白皮松幼苗能平安越冬，于11月中旬澆封凍水，并對白皮松幼苗舉行埋土防寒，次年春除去防寒土后實時澆解凍水。