芍藥褐斑病也稱芍藥紅斑病，是種植芍藥中較常見的重要病害。由牡丹枝孢霉菌引起，病原菌重要以菌絲體在病葉、病枝條以及落地的病殘株上越冬。翌年春季發生分生孢子經氣流和雨水或風傳播到剛萌發的新葉上，一般植株下部葉片較先感病，逐漸伸張至整株葉片，感病葉片初期出現略圓型綠色針頭狀小黑點，嚴重時整葉焦枯，秋季病斑變黑褐色，焦脆，易破碎。后期病斑后頭會出現墨綠色霉狀物，病害也浸染幼莖，在莖上出現紫褐色長圓形小點，有些突起，病斑擴展慢，嚴重時也可相連成片。
防治方式：
1.秋冬季徹底清除病株病葉集中銷毀。
2.加強種植管理，注重栽植密度，以利增添透風、透光；增施有機肥，提高土壤的保水保肥能力，加強植株的抗病性，促進植株結實生長。
3.從開花至雨季結束每半月噴一次140倍等量式波爾多液，可基本防治病害發生。
4.發病初期，可噴甲基托布津可濕性粉劑1200倍液或50％多菌靈可濕性粉劑1000倍液，每隔7至10天噴1次，延續噴4至5次。